危姓源出有三：地名、姬姓和改姓。

第一支出自地名。相传古缙云氏之后有三苗古国，故地在今湖南、湖北、江西一带。后徙三危，故地在今甘肃敦煌地区，其后有危氏，以地名为氏。

第二支源出姬姓。卫国之后有危姓。其先自洛即洛水流域徙汝南，又徙江南。

第三支来自改姓。明时与宋濂同著《元史》之危素，其祖本姓黄，冒姓危。